Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CLTCQ00610 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms