Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP1Q00587 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms