Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms