Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms