Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRB1P82279 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CRB1P82279 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRB1P82279 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRB1P82279 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRB1P82279 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CRB1P82279 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CRB1P82279 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CRB1P82279 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CRB1P82279 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CRB1P82279 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CRB1P82279 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CRB1P82279 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CRB1P82279 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CRB1P82279 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CRB1P82279 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CRB1P82279 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CRB1P82279 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CRB1P82279 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CRB1P82279 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CRB1P82279 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CRB1P82279 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRB1P82279 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRB1P82279 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRB1P82279 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRB1P82279 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRB1P82279 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRB1P82279 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRB1P82279 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CRB1P82279 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRB1P82279 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRB1P82279 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRB1P82279 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRB1P82279 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRB1P82279 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRB1P82279 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRB1P82279 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRB1P82279 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRB1P82279 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRB1P82279 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRB1P82279 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRB1P82279 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRB1P82279 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRB1P82279 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRB1P82279 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRB1P82279 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRB1P82279 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CRB1P82279 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRB1P82279 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRB1P82279 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRB1P82279 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRB1P82279 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRB1P82279 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRB1P82279 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CRB1P82279 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRB1P82279 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRB1P82279 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CRB1P82279 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRB1P82279 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRB1P82279 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CRB1P82279 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CRB1P82279 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRB1P82279 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRB1P82279 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRB1P82279 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRB1P82279 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRB1P82279 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRB1P82279 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRB1P82279 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRB1P82279 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRB1P82279 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRB1P82279 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CRB1P82279 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRB1P82279 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRB1P82279 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRB1P82279 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRB1P82279 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRB1P82279 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRB1P82279 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRB1P82279 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRB1P82279 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRB1P82279 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRB1P82279 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRB1P82279 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRB1P82279 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRB1P82279 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRB1P82279 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CRB1P82279 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms