Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX3P78415 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX3P78415 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX3P78415 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX3P78415 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX3P78415 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX3P78415 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX3P78415 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX3P78415 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX3P78415 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX3P78415 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX3P78415 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX3P78415 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX3P78415 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX3P78415 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX3P78415 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX3P78415 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX3P78415 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX3P78415 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX3P78415 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX3P78415 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX3P78415 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX3P78415 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX3P78415 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX3P78415 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX3P78415 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX3P78415 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX3P78415 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX3P78415 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX3P78415 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX3P78415 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX3P78415 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX3P78415 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX3P78415 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX3P78415 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX3P78415 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX3P78415 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX3P78415 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX3P78415 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX3P78415 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX3P78415 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms