Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX4P78413 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX4P78413 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX4P78413 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX4P78413 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX4P78413 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX4P78413 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX4P78413 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX4P78413 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX4P78413 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX4P78413 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX4P78413 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX4P78413 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX4P78413 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX4P78413 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX4P78413 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX4P78413 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX4P78413 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX4P78413 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX4P78413 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX4P78413 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX4P78413 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX4P78413 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX4P78413 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX4P78413 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX4P78413 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX4P78413 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX4P78413 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX4P78413 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX4P78413 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX4P78413 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms