Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM4P67936 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM4P67936 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM4P67936 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM4P67936 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM4P67936 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM4P67936 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM4P67936 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM4P67936 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM4P67936 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM4P67936 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM4P67936 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM4P67936 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM4P67936 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM4P67936 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM4P67936 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM4P67936 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM4P67936 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM4P67936 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM4P67936 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM4P67936 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM4P67936 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPM4P67936 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPM4P67936 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM4P67936 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM4P67936 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM4P67936 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM4P67936 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM4P67936 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM4P67936 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM4P67936 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM4P67936 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM4P67936 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM4P67936 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM4P67936 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM4P67936 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM4P67936 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM4P67936 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM4P67936 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM4P67936 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM4P67936 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPM4P67936 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM4P67936 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM4P67936 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM4P67936 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM4P67936 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM4P67936 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM4P67936 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM4P67936 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM4P67936 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM4P67936 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM4P67936 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM4P67936 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM4P67936 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM4P67936 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM4P67936 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM4P67936 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM4P67936 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM4P67936 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM4P67936 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM4P67936 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM4P67936 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM4P67936 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM4P67936 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM4P67936 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms