Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms