Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOBP62745 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOBP62745 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOBP62745 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOBP62745 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOBP62745 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHOBP62745 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHOBP62745 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHOBP62745 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHOBP62745 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOBP62745 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOBP62745 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOBP62745 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOBP62745 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOBP62745 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOBP62745 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOBP62745 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOBP62745 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOBP62745 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOBP62745 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOBP62745 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOBP62745 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOBP62745 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOBP62745 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOBP62745 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOBP62745 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOBP62745 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOBP62745 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOBP62745 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOBP62745 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOBP62745 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOBP62745 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOBP62745 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOBP62745 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms