Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO4P61968 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO4P61968 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO4P61968 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO4P61968 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO4P61968 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO4P61968 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO4P61968 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO4P61968 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO4P61968 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO4P61968 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMO4P61968 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO4P61968 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO4P61968 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO4P61968 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO4P61968 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO4P61968 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO4P61968 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO4P61968 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMO4P61968 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO4P61968 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO4P61968 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO4P61968 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO4P61968 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO4P61968 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO4P61968 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO4P61968 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO4P61968 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO4P61968 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO4P61968 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO4P61968 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO4P61968 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO4P61968 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO4P61968 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO4P61968 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO4P61968 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO4P61968 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO4P61968 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO4P61968 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO4P61968 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO4P61968 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO4P61968 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMO4P61968 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO4P61968 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO4P61968 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO4P61968 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO4P61968 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO4P61968 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms