Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms