Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVS71-1P61550 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVS71-1P61550 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVS71-1P61550 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVS71-1P61550 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVS71-1P61550 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVS71-1P61550 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVS71-1P61550 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVS71-1P61550 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVS71-1P61550 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVS71-1P61550 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVS71-1P61550 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms