Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS2P61201 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS2P61201 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS2P61201 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS2P61201 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS2P61201 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS2P61201 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS2P61201 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS2P61201 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS2P61201 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS2P61201 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS2P61201 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS2P61201 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS2P61201 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS2P61201 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS2P61201 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS2P61201 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS2P61201 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS2P61201 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS2P61201 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS2P61201 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS2P61201 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS2P61201 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS2P61201 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS2P61201 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS2P61201 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS2P61201 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS2P61201 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COPS2P61201 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS2P61201 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS2P61201 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS2P61201 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS2P61201 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS2P61201 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS2P61201 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS2P61201 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS2P61201 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS2P61201 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS2P61201 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS2P61201 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS2P61201 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms