Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP9P55211 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP9P55211 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP9P55211 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP9P55211 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP9P55211 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP9P55211 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP9P55211 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP9P55211 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP9P55211 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP9P55211 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP9P55211 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP9P55211 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP9P55211 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP9P55211 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP9P55211 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP9P55211 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP9P55211 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP9P55211 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP9P55211 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP9P55211 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP9P55211 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP9P55211 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP9P55211 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP9P55211 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP9P55211 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP9P55211 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP9P55211 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms