Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms