Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MANFP55145 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MANFP55145 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MANFP55145 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MANFP55145 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MANFP55145 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MANFP55145 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MANFP55145 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MANFP55145 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MANFP55145 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MANFP55145 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MANFP55145 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MANFP55145 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MANFP55145 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MANFP55145 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MANFP55145 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MANFP55145 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MANFP55145 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MANFP55145 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MANFP55145 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MANFP55145 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MANFP55145 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MANFP55145 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MANFP55145 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MANFP55145 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MANFP55145 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MANFP55145 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MANFP55145 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MANFP55145 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MANFP55145 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MANFP55145 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MANFP55145 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MANFP55145 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MANFP55145 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MANFP55145 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms