Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPP55072 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPP55072 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPP55072 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPP55072 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPP55072 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPP55072 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPP55072 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPP55072 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPP55072 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCPP55072 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCPP55072 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPP55072 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPP55072 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPP55072 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPP55072 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPP55072 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPP55072 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPP55072 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPP55072 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCPP55072 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCPP55072 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCPP55072 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCPP55072 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCPP55072 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCPP55072 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms