Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GYS2P54840 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GYS2P54840 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GYS2P54840 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYS2P54840 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYS2P54840 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GYS2P54840 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GYS2P54840 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GYS2P54840 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GYS2P54840 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GYS2P54840 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GYS2P54840 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GYS2P54840 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GYS2P54840 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GYS2P54840 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GYS2P54840 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GYS2P54840 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GYS2P54840 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GYS2P54840 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GYS2P54840 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GYS2P54840 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GYS2P54840 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GYS2P54840 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GYS2P54840 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GYS2P54840 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GYS2P54840 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GYS2P54840 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GYS2P54840 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GYS2P54840 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GYS2P54840 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GYS2P54840 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GYS2P54840 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GYS2P54840 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GYS2P54840 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GYS2P54840 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GYS2P54840 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GYS2P54840 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GYS2P54840 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GYS2P54840 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GYS2P54840 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GYS2P54840 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GYS2P54840 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GYS2P54840 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GYS2P54840 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GYS2P54840 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GYS2P54840 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GYS2P54840 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GYS2P54840 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GYS2P54840 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GYS2P54840 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms