Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms