Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms