Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PGGT1BP53609 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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