Protein–RNA interactions for Protein: P53189

SCW11, Probable family 17 glucosidase SCW11, yeast

Predictions only

Length 542 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW11	P53189	TCM62	YBR044C	1719 nt		5.96	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	CSC1	YLR241W	2349 nt		5.96	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	STB5	YHR178W	2232 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	PHR1	YOR386W	1698 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	KEL1	YHR158C	3495 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YCL076W	YCL076W	744 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	RMD6	YEL072W	696 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YER107W-A	YER107W-A	321 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	SYN8	YAL014C	768 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YJR111C	YJR111C	852 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YML6	YML025C	861 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YNL092W	YNL092W	1203 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	ADY3	YDL239C	2373 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	MIC60	YKR016W	1623 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	HXT2	YMR011W	1626 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	AZR1	YGR224W	1842 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YBR284W	YBR284W	2394 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	ERC1	YHR032W	1746 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	PGM1	YKL127W	1713 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	PER1	YCR044C	1074 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	UBC9	YDL064W	474 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	DAD1	YDR016C	285 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	UBC13	YDR092W	462 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YDR491C	YDR491C	492 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	DFG10	YIL049W	762 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	COA1	YIL157C	594 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YJR146W	YJR146W	354 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YKL077W	YKL077W	1179 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YLL056C	YLL056C	897 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	SEN34	YAR008W	828 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YSF3	YNL138W-A	258 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	OST2	YOR103C	393 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	TMA16	YOR252W	537 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	GGA1	YDR358W	1674 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	CNA1	YLR433C	1662 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	CDC37	YDR168W	1521 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	MRE11	YMR224C	2079 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	GIT1	YCR098C	1557 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	LAT1	YNL071W	1449 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	GAS4	YOL132W	1416 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	TAM41	YGR046W	1158 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YIR042C	YIR042C	711 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YLR290C	YLR290C	834 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	RRT16	YNL105W	429 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	MDG1	YNL173C	1101 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	MCK1	YNL307C	1128 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	COQ3	YOL096C	939 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	STP22	YCL008C	1158 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YCL012C	YCL012C	405 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	ATE1	YGL017W	1512 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	JJJ1	YNL227C	1773 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	THI20	YOL055C	1656 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	HXT3	YDR345C	1704 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	RIM1	YCR028C-A	408 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	PEX21	YGR239C	867 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	DAL3	YIR032C	588 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	HIT1	YJR055W	495 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	RAD33	YML011C	534 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	CGI121	YML036W	546 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	MRP21	YBL090W	534 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	RPL3	YOR063W	1164 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	RKI1	YOR095C	777 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	CAT5	YOR125C	702 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	CDC19	YAL038W	1503 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	EMP46	YLR080W	1335 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	NUP49	YGL172W	1419 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	VMA13	YPR036W	1437 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	SIR1	YKR101W	1965 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	BUD8	YLR353W	1812 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	COX9	YDL067C	180 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	GRX2	YDR513W	432 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	LCB3	YJL134W	1230 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YAL019W-A	YAL019W-A	570 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YMR254C	YMR254C	309 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	AIM39	YOL053W	1188 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	FET4	YMR319C	1659 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	GPI19	YDR437W	423 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	GET1	YGL020C	708 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YGR107W	YGR107W	450 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YAP5	YIR018W	738 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YLR297W	YLR297W	390 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	TAL1	YLR354C	1008 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	LST8	YNL006W	912 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	YOR053W	YOR053W	342 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SCW11	P53189	HRQ1	YDR291W	3234 nt		5.9	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	YIL055C	YIL055C	1884 nt		5.9	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	SWF1	YDR126W	1011 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	YER034W	YER034W	558 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	YHR130C	YHR130C	336 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	TFS1	YLR178C	660 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	YMR141C	YMR141C	309 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	MRPL19	YNL185C	477 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	YRB30	YGL164C	1323 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	TRM12	YML005W	1389 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	YML020W	YML020W	1995 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	MRC1	YCL061C	3291 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	PGS1	YCL004W	1566 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	TBF1	YPL128C	1689 nt		5.88	□□□□□ -1.47
SCW11	P53189	MAL12	YGR292W	1755 nt		5.88	□□□□□ -1.47

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms