Protein–RNA interactions for Protein: P53172

SDS23, Protein SDS23, yeast

Predictions only

Length 527 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SDS23	P53172	IST1	YNL265C	897 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SDS23	P53172	YNR071C	YNR071C	1029 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SDS23	P53172	TAF14	YPL129W	735 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SDS23	P53172	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SDS23	P53172	PMS1	YNL082W	2622 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SDS23	P53172	RAD54	YGL163C	2697 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	BCK2	YER167W	2556 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YDL026W	YDL026W	312 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	RPS13	YDR064W	456 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	ARO2	YGL148W	1131 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YIL025C	YIL025C	375 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	PRM10	YJL108C	1152 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YUH1	YJR099W	711 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	OMA1	YKR087C	1038 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YAL069W	YAL069W	315 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YLR407W	YLR407W	687 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	SIW14	YNL032W	846 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YPT53	YNL093W	663 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	VPS68	YOL129W	555 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	PSF3	YOL146W	585 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	SPT23	YKL020C	3249 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	TRK1	YJL129C	3708 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	BUD5	YCR038C	1929 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	PUB1	YNL016W	1362 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	CTK1	YKL139W	1587 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	TAF10	YDR167W	621 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YDR222W	YDR222W	1248 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YGL088W	YGL088W	366 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	POP6	YGR030C	477 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	LSB1	YGR136W	726 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	RSM25	YIL093C	795 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	AIM22	YJL046W	1230 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	NIT3	YLR351C	876 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	GLO4	YOR040W	858 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	IAH1	YOR126C	717 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	UAF30	YOR295W	687 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	TIF5	YPR041W	1218 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	MLH2	YLR035C	2088 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	MGR3	YMR115W	1506 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	NOP58	YOR310C	1536 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	SHU2	YDR078C	672 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	TOS8	YGL096W	831 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	SRP40	YKR092C	1221 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	ERG3	YLR056W	1098 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	TMC1	YOR052C	453 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	OPY1	YBR129C	987 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	GDT1	YBR187W	843 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	RNA14	YMR061W	2034 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	MEF1	YLR069C	2286 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	SSH4	YKL124W	1740 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	FLO8	YER109C	2400 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	TRE2	YOR256C	2430 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	ZDS1	YMR273C	2748 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YDL027C	YDL027C	1263 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	RTA1	YGR213C	954 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YHR112C	YHR112C	1137 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	DID4	YKL002W	699 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YLR156W	YLR156W	345 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YLR159W	YLR159W	345 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YLR161W	YLR161W	345 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	URE2	YNL229C	1065 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YIF1	YNL263C	945 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	IRC14	YOR135C	342 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	PPZ1	YML016C	2079 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	AIM21	YIR003W	2040 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	PRS5	YOL061W	1491 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	CLN2	YPL256C	1638 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	SEM1	YDR363W-A	270 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	MIC26	YGR235C	702 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	BNA1	YJR025C	534 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YKR015C	YKR015C	1707 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	TEX1	YNL253W	1269 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	UTP23	YOR004W	765 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	RTS1	YOR014W	2274 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	NOP8	YOL144W	1455 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	VPS27	YNR006W	1869 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	TRM1	YDR120C	1713 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	CTH1	YDR151C	978 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YDR290W	YDR290W	330 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YDR391C	YDR391C	699 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	DDI2	YFL061W	678 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	TFA2	YKR062W	987 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YML053C	YML053C	639 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	YBL036C	YBL036C	774 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	MDJ2	YNL328C	441 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	DDI3	YNL335W	678 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	REX4	YOL080C	870 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	CIN5	YOR028C	888 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	FRM2	YCL026C-A	582 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	NCR1	YPL006W	3513 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	NTH1	YDR001C	2256 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	GAC1	YOR178C	2382 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	FLC1	YPL221W	2382 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	BIK1	YCL029C	1323 nt		3.21	□□□□□ -1.89
SDS23	P53172	MNR2	YKL064W	2910 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SDS23	P53172	RTC1	YOL138C	4026 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SDS23	P53172	YCL076W	YCL076W	744 nt		3.21	□□□□□ -1.9

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