Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCNKBP51801 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms