Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
SMARCA2P51531 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SMARCA2P51531 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms