Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK7P50613 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK7P50613 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK7P50613 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK7P50613 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK7P50613 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK7P50613 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK7P50613 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK7P50613 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK7P50613 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK7P50613 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK7P50613 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK7P50613 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK7P50613 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK7P50613 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK7P50613 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK7P50613 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK7P50613 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK7P50613 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK7P50613 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK7P50613 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK7P50613 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK7P50613 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK7P50613 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK7P50613 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK7P50613 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK7P50613 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK7P50613 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK7P50613 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK7P50613 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK7P50613 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK7P50613 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK7P50613 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms