Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ETV1P50549 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ETV1P50549 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ETV1P50549 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ETV1P50549 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ETV1P50549 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ETV1P50549 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ETV1P50549 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ETV1P50549 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ETV1P50549 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ETV1P50549 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ETV1P50549 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ETV1P50549 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ETV1P50549 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms