Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF6P49848 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF6P49848 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF6P49848 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF6P49848 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF6P49848 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF6P49848 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF6P49848 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF6P49848 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF6P49848 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF6P49848 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF6P49848 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF6P49848 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF6P49848 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF6P49848 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF6P49848 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF6P49848 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF6P49848 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF6P49848 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF6P49848 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF6P49848 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF6P49848 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF6P49848 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF6P49848 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF6P49848 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF6P49848 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF6P49848 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF6P49848 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF6P49848 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF6P49848 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF6P49848 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF6P49848 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF6P49848 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF6P49848 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF6P49848 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF6P49848 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF6P49848 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF6P49848 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF6P49848 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF6P49848 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF6P49848 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF6P49848 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF6P49848 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF6P49848 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF6P49848 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF6P49848 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF6P49848 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF6P49848 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF6P49848 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF6P49848 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF6P49848 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF6P49848 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF6P49848 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF6P49848 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF6P49848 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF6P49848 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF6P49848 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF6P49848 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF6P49848 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF6P49848 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF6P49848 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF6P49848 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF6P49848 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF6P49848 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF6P49848 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF6P49848 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF6P49848 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF6P49848 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF6P49848 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF6P49848 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF6P49848 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms