Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTBP49356 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTBP49356 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTBP49356 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTBP49356 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTBP49356 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTBP49356 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTBP49356 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTBP49356 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTBP49356 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTBP49356 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNTBP49356 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNTBP49356 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNTBP49356 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNTBP49356 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNTBP49356 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNTBP49356 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTBP49356 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTBP49356 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTBP49356 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTBP49356 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTBP49356 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTBP49356 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTBP49356 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTBP49356 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTBP49356 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTBP49356 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNTBP49356 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNTBP49356 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTBP49356 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTBP49356 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTBP49356 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTBP49356 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTBP49356 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTBP49356 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTBP49356 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTBP49356 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNTBP49356 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTBP49356 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTBP49356 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTBP49356 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTBP49356 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTBP49356 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTBP49356 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNTBP49356 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms