Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGM4P49221 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGM4P49221 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGM4P49221 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGM4P49221 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM4P49221 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM4P49221 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM4P49221 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM4P49221 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM4P49221 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM4P49221 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM4P49221 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM4P49221 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM4P49221 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM4P49221 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM4P49221 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM4P49221 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TGM4P49221 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGM4P49221 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGM4P49221 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TGM4P49221 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TGM4P49221 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TGM4P49221 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms