Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms