Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF4P48230 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms