Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME1P48163 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME1P48163 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME1P48163 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME1P48163 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME1P48163 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME1P48163 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME1P48163 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME1P48163 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME1P48163 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME1P48163 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME1P48163 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME1P48163 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME1P48163 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ME1P48163 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME1P48163 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME1P48163 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME1P48163 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME1P48163 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME1P48163 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME1P48163 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME1P48163 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME1P48163 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME1P48163 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME1P48163 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME1P48163 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME1P48163 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME1P48163 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME1P48163 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME1P48163 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME1P48163 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME1P48163 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME1P48163 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME1P48163 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ME1P48163 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ME1P48163 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME1P48163 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME1P48163 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME1P48163 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME1P48163 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME1P48163 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME1P48163 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME1P48163 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME1P48163 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME1P48163 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME1P48163 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME1P48163 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ME1P48163 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms