Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms