Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRATP43155 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRATP43155 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRATP43155 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRATP43155 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRATP43155 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRATP43155 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRATP43155 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRATP43155 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRATP43155 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRATP43155 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRATP43155 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRATP43155 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRATP43155 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRATP43155 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRATP43155 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRATP43155 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRATP43155 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRATP43155 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRATP43155 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRATP43155 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRATP43155 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRATP43155 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRATP43155 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRATP43155 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRATP43155 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRATP43155 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRATP43155 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRATP43155 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRATP43155 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRATP43155 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRATP43155 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRATP43155 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRATP43155 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRATP43155 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRATP43155 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRATP43155 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms