Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms