Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A1P43005 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms