Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA2P42262 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms