Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THPOP40225 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THPOP40225 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THPOP40225 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THPOP40225 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THPOP40225 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THPOP40225 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THPOP40225 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THPOP40225 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THPOP40225 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THPOP40225 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THPOP40225 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THPOP40225 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THPOP40225 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THPOP40225 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
THPOP40225 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THPOP40225 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
THPOP40225 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THPOP40225 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THPOP40225 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THPOP40225 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THPOP40225 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THPOP40225 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THPOP40225 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THPOP40225 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
THPOP40225 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THPOP40225 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THPOP40225 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THPOP40225 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THPOP40225 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THPOP40225 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THPOP40225 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THPOP40225 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THPOP40225 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THPOP40225 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THPOP40225 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THPOP40225 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THPOP40225 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THPOP40225 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THPOP40225 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THPOP40225 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THPOP40225 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THPOP40225 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THPOP40225 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THPOP40225 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THPOP40225 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THPOP40225 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THPOP40225 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THPOP40225 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THPOP40225 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THPOP40225 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THPOP40225 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
THPOP40225 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
THPOP40225 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THPOP40225 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THPOP40225 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THPOP40225 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THPOP40225 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THPOP40225 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THPOP40225 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THPOP40225 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THPOP40225 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THPOP40225 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
THPOP40225 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THPOP40225 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THPOP40225 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THPOP40225 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THPOP40225 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THPOP40225 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms