Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXLNAP40222 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXLNAP40222 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms