Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 HMF1YER057C 390 nt4.06□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 YLR346CYLR346C 306 nt4.06□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 TIP20YGL145W 2106 nt4.06□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 YOR022CYOR022C 2148 nt4.06□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 MUP3YHL036W 1641 nt4.06□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 ZDS1YMR273C 2748 nt4.05□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 YME2YMR302C 2553 nt4.05□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 TRE1YPL176C 2352 nt4.05□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 BCD1YHR040W 1101 nt4.05□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 DEG1YFL001W 1329 nt4.04□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 RPN3YER021W 1572 nt4.04□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 YGR016WYGR016W 573 nt4.04□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 ARO9YHR137W 1542 nt4.04□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 SPT6YGR116W 4356 nt4.04□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 REE1YJL217W 597 nt4.03□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 OXR1YPL196W 822 nt4.03□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 TYW1YPL207W 2433 nt4.03□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 SEN1YLR430W 6696 nt4.03□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 FRE8YLR047C 2061 nt4.03□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 NCE103YNL036W 666 nt4.03□□□□□ -1.76
YRF1-2P40105 CIT1YNR001C 1440 nt4.03□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 VPS41YDR080W 2979 nt4.02□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 RPL23BYER117W 414 nt4.02□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YOR331CYOR331C 558 nt4.02□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 RPS12YOR369C 432 nt4.02□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 NMD2YHR077C 3270 nt4.02□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YKL107WYKL107W 930 nt4.01□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 COA2YPL189C-A 207 nt4.01□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 SUP45YBR143C 1314 nt4.01□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 RPP1AYDL081C 321 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YAR069CYAR069C 294 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 PRE8YML092C 753 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YMR087WYMR087W 855 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 HER2YMR293C 1395 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 NNK1YKL171W 2787 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YKR023WYKR023W 1593 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 RPB9YGL070C 369 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 GPI14YJR013W 1212 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YLR257WYLR257W 966 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 RRG9YNL213C 645 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 SME1YOR159C 285 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 RPL36BYPL249C-A 303 nt4□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 TAF1YGR274C 3201 nt3.99□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YAL004WYAL004W 648 nt3.99□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 DIB1YPR082C 432 nt3.99□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 MNL1YHR204W 2391 nt3.99□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 MDM34YGL219C 1380 nt3.99□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 STP4YDL048C 1473 nt3.99□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 POL31YJR006W 1464 nt3.99□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YKL222CYKL222C 2118 nt3.99□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 UGA3YDL170W 1587 nt3.99□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 APL6YGR261C 2430 nt3.99□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 BCH1YMR237W 2175 nt3.98□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 VPS64YDR200C 1815 nt3.98□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 ARO10YDR380W 1908 nt3.98□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YDL023CYDL023C 321 nt3.98□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YDR526CYDR526C 471 nt3.98□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 RPL18AYOL120C 561 nt3.98□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 FMP25YLR077W 1752 nt3.98□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 GET1YGL020C 708 nt3.97□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 SSB1YDL229W 1842 nt3.97□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 DHR2YKL078W 2208 nt3.97□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YLR001CYLR001C 2589 nt3.97□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YAK1YJL141C 2424 nt3.97□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 VEL1YGL258W 621 nt3.97□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YLR339CYLR339C 552 nt3.97□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 YBR226CYBR226C 411 nt3.97□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 XRS2YDR369C 2565 nt3.97□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 CHS5YLR330W 2016 nt3.96□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 REC8YPR007C 2043 nt3.96□□□□□ -1.77
YRF1-2P40105 NUP133YKR082W 3474 nt3.96□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 SSE2YBR169C 2082 nt3.96□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 YDL176WYDL176W 2127 nt3.96□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 GCR2YNL199C 1605 nt3.96□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 MHO1YJR008W 1017 nt3.96□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 GAS4YOL132W 1416 nt3.96□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 YGL140CYGL140C 3660 nt3.95□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 GUP1YGL084C 1683 nt3.95□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 ATP5YDR298C 639 nt3.95□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 SEC27YGL137W 2670 nt3.95□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 EPL1YFL024C 2499 nt3.94□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 HPC2YBR215W 1878 nt3.94□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 SRP40YKR092C 1221 nt3.94□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 FZO1YBR179C 2568 nt3.94□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 IKI3YLR384C 4050 nt3.94□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 FAA2YER015W 2235 nt3.94□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 CHS3YBR023C 3498 nt3.94□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 MIG3YER028C 1185 nt3.94□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 DOG1YHR044C 741 nt3.94□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 PAM18YLR008C 507 nt3.94□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 SHH3YMR118C 591 nt3.94□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 CDC40YDR364C 1368 nt3.93□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 NUP85YJR042W 2235 nt3.93□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 PDR3YBL005W 2931 nt3.93□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 MSE1YOL033W 1611 nt3.92□□□□□ -1.78
YRF1-2P40105 HBT1YDL223C 3141 nt3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms