Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGP37231 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPARGP37231 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGP37231 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGP37231 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGP37231 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGP37231 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGP37231 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGP37231 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGP37231 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGP37231 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGP37231 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGP37231 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms