Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6V1E1P36543 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms