Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5C1P36542 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP5C1P36542 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms