Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC4P35249 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC4P35249 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC4P35249 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFC4P35249 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFC4P35249 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC4P35249 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC4P35249 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC4P35249 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC4P35249 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC4P35249 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC4P35249 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC4P35249 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFC4P35249 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC4P35249 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC4P35249 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC4P35249 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC4P35249 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFC4P35249 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFC4P35249 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RFC4P35249 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC4P35249 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC4P35249 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC4P35249 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC4P35249 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC4P35249 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC4P35249 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFC4P35249 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFC4P35249 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFC4P35249 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFC4P35249 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFC4P35249 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFC4P35249 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFC4P35249 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFC4P35249 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFC4P35249 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFC4P35249 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFC4P35249 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFC4P35249 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFC4P35249 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFC4P35249 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFC4P35249 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RFC4P35249 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFC4P35249 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RFC4P35249 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFC4P35249 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFC4P35249 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFC4P35249 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms