Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA1P35221 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms