Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFNP31947 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFNP31947 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFNP31947 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFNP31947 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFNP31947 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFNP31947 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFNP31947 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFNP31947 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFNP31947 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFNP31947 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFNP31947 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFNP31947 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFNP31947 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFNP31947 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFNP31947 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFNP31947 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFNP31947 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFNP31947 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFNP31947 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFNP31947 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFNP31947 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SFNP31947 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFNP31947 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFNP31947 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SFNP31947 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFNP31947 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFNP31947 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFNP31947 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFNP31947 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFNP31947 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFNP31947 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFNP31947 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFNP31947 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SFNP31947 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFNP31947 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFNP31947 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFNP31947 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFNP31947 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFNP31947 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFNP31947 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFNP31947 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFNP31947 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFNP31947 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFNP31947 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFNP31947 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms