Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA10P31260 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms