Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD34P28906 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD34P28906 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD34P28906 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD34P28906 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CD34P28906 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD34P28906 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD34P28906 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD34P28906 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD34P28906 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD34P28906 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD34P28906 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD34P28906 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD34P28906 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD34P28906 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD34P28906 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD34P28906 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD34P28906 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CD34P28906 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD34P28906 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD34P28906 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD34P28906 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD34P28906 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD34P28906 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD34P28906 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD34P28906 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD34P28906 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms